Doktorandtjänst (PhD) i DNA nanoteknologi och cell signal reglering

Vill du bidra till medicinsk forskning av toppkvalitet?

Att vara doktorand innebär att vara antagen till en utbildning på forskarnivå (forskarutbildning) där man följer en individuell studieplan. En doktorand ägnar sig åt ett forskningsprojekt under handledning, kompletterat med kurser och andra lärandeaktiviteter. För en doktorsexamen krävs motsvarande fyra års utbildning på forskarnivå på heltid.

Forskargruppen

Högberggruppen är en del av avdelningen för medicinska systems bioteknik vid institutionen för medicinsk biokemi och biofysik vid Karolinska Institutet (KI), som omfattar fem forskargrupper vars arbete fokuserar på att skapa nya biotekniska metoder och nya material för cellbiologisk forskning. Vårt mångsidiga team av fysiker, biologer, kemister och beräkningsbiologer är en ledande grupp inom fältet DNA-nanoteknik, specialiserad på att skapa molekylära verktyg för livsvetenskaplig forskning. Vi erbjuder en stimulerande vetenskaplig miljö och en forskningsinfrastruktur i toppklass, både lokalt, på avdelningsnivå och institutionsnivå.

Doktorandprojektet och doktorandens uppgifter

Detta projekt syftar till att klargöra de molekylära mekanismerna bakom Notch-signalering och vilken roll proteaset ADAM10 spelar i denna. Traditionella modeller tyder på att Notch-aktivering kräver en fysisk ”dragkraft”, men vårt senaste arbete visar att Notch kan aktiveras på ett kraftoberoende sätt med hjälp av multivalenta DNA-origami-agonister som uppvisar nanomönster av Notch-ligander. Doktoranden kommer att utforska alternativa mekanismer som kan förklara hur Notch-signalvägen aktiveras samt utvärdera om DNA-origami-nanoenheter kan designas för att påverka denna process in vivo.

Huvudsakliga arbetsuppgifter och mål kan inkludera:

• Kartläggning av molekylära interaktörer: Upptäcka vilka proteiner som interagerar med nyckelaktörerna inom denna signalväg, genom att använda toppmoderna verktyg för att bygga en omfattande molekylär karta över cellens signalmaskineri.
• Funktionell karakterisering: Undersöka de funktionella rollerna hos nyligen identifierade molekylära aktörer genom att selektivt stänga av enskilda gener och mäta hur detta påverkar cellsignaleringen på molekylär nivå.
• Avancerad avbildning: Fånga detaljerade bilder av hur signalmolekyler är rumsligt organiserade på cellytan med hjälp av banbrytande superresolutions- och elektronmikroskopitekniker som kan avslöja strukturer som är långt mindre än ljusets våglängd.
• In vivo-translation: Validera funktionen hos DNA-nanoenheter i levande organismer genom att använda djurmodeller för olika sjukdomar för att utforska om dessa molekylära verktyg kan reversera sjukdomssymtom och öppna nya terapeutiska möjligheter. 
• Konstruktion på nanonivå: Konstruera optimerade DNA-nanostrukturer som med precision kan kontrollera aktiviteten hos viktiga signalproteiner, med långsiktig potential för att behandla cancer och neurodegenerativa sjukdomar som Alzheimers sjukdom. 

Vad erbjuder vi? 

En kreativ, internationell och inspirerande miljö fylld av kompetens och nyfikenhet. Karolinska Institutet är ett av världens ledande medicinska universitet. Här bedriver vi framgångsrik medicinsk forskning och har det största utbudet av medicinska utbildningar i Sverige. På KI får du träffa forskare med olika forskningsinriktningar som jobbar tillsammans. Det är det gränsöverskridande samarbetet som bidrar till KI:s världsledande position inom forskning. Som doktorand erbjuds du ett individuellt forskningsprojekt, en välutbildad handledare, ett stort utbud av valbara kurser och möjligheten att arbeta i en framgångsrik forskargrupp. Karolinska Institutet har samarbeten med framstående universitet över hela världen, vilket ger möjlighet till internationella utbyten. Som anställd doktorand får du en avtalsenlig lön, du får träna fritt i våra moderna friskvårdsanläggningar och du får ersättning för läkarvård.

Behörighetskrav för utbildning på forskarnivå

För att delta i urvalet till en doktorandplats måste du styrka både det grundläggande (A) och det särskilda (B) behörighetskravet innan ansökningsperioden stänger.

Det är ditt ansvar som sökande att styrka din behörighet genom att följa instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

A) Grundläggande behörighetskrav

Du uppfyller det grundläggande behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

1. har avlagt en examen på avancerad nivå (magister- eller masterexamen), eller
2. har fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller
3. har på annat sätt förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.*

Följ instruktionerna på webbsidan Behörighet till utbildning på forskarnivå.

*Om du anser dig ha motsvarande kunskaper ska du följa instruktionerna på webbsidan Bedömning av motsvarande kunskaper för grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå.

B) Särskilt behörighetskrav

Du uppfyller det särskilda behörighetskravet för utbildning på forskarnivå om du:

- Intygar kunskaper i engelska (motsvarande Engelska B/Engelska 6 vid gymnasiet med godkänt betyg).

Följ instruktionerna på webbsidan English language requirements for doctoral education.

Kontroll av dokument Karolinska Institutet gör kontroll av dokumenten för att upptäcka förfalskningar. Karolinska Institutet förbehåller sig rätten att återkalla antagningsbeslut om förfalskningar eller oriktigheter påvisas. Inlämnande av falska handlingar är ett brott mot svensk lag och anses vara grund för rättsliga åtgärder.

Färdigheter och personliga egenskaper

Den ideala kandidaten bör ha en bakgrund inom molekylärbiologi, fysik, kemi, bioteknik eller ett relaterat område. Teknisk skicklighet inom cellodling, molekylär kloning och avancerad mikroskopi är mycket meriterande. Erfarenhet av DNA-nanoteknik, närhetsmärkning (proximity labeling/BioID/TurboID) eller in vivo-musmodeller är en betydande fördel samt av programmering och AI-verktyg.

Vi söker en mycket motiverad, kreativ och samarbetsvillig person och som trivs med att arbeta i en tvärvetenskaplig miljö. Förmåga att utföra laboratoriearbete och dokumentera resultat på ett noggrant och strukturerat sätt, samt att diskutera och presentera resultat på ett utförligt sätt, är ett krav.

Villkor

Doktorandplatsen innebär en anställning som doktorand under maximalt 4 år på heltid.

Ansökan

Du söker doktorandplatsen i rekryteringsverktyget Varbi. Använd knappen uppe till höger och följ anvisningarna. Vi ser gärna att din ansökan är skriven på engelska, men det går också bra att ansöka på svenska.

Din ansökan ska innehålla dessa dokument:

- Ett personligt brev och curriculum vitae 
- Eventuella examensarbeten och publikationer 
- Andra dokument som styrker de ovan efterfrågade färdigheter och egenskaper 
- Dokument som styrker det grundläggande behörighetskravet (se A ovan)
- Dokument som styrker det särskilda behörighetskravet (se B ovan)

Urval

Urval bland behöriga sökande görs med hänsyn till deras förmåga att tillgodogöra sig forskarutbildning. En samlad bedömning av de sökandes meriter och lämplighet kommer att göras.

Följande bedömningsgrunder tillämpas vid Karolinska Institutet:

- Dokumenterade ämneskunskaper av betydelse för forskningsområdet
- Analytisk skicklighet
- Övriga dokumenterade kunskaper/erfarenheter som kan ha betydelse för aktuell forskarutbildning  

Alla sökanden kommer att få information när rekryteringen är slutförd.

Department of Medical Biochemistry and Biophysics | Karolinska Institutet

Björn Högberg group | Karolinska Institutet

Vill du göra skillnad - och bidra till en bättre hälsa för alla? Sök till Karolinska Institutet

1. Ferenc Fördös, [email protected]

1. Anurupa Nagchowdhury, [email protected]